Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx2-3P97334 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nkx2-3P97334 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms