Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbx1P82976 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbx1P82976 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms