Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gjb6P70689 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb6P70689 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms