Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aup1P70295 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aup1P70295 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aup1P70295 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aup1P70295 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aup1P70295 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aup1P70295 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aup1P70295 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Aup1P70295 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aup1P70295 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Aup1P70295 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Aup1P70295 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aup1P70295 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms