Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vamp7P70280 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vamp7P70280 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp7P70280 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 608.6 ms