Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps3P62908 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps3P62908 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3P62908 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3P62908 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps3P62908 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3P62908 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3P62908 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3P62908 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms