Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gnb1P62874 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gnb1P62874 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms