Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snrpd1P62315 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snrpd1P62315 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms