Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf13P61216 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf13P61216 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf13P61216 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf13P61216 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf13P61216 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms