Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sssca1P56873 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sssca1P56873 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms