Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckbrP56481 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckbrP56481 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CckbrP56481 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms