Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gp1bbP56400 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gp1bbP56400 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp1bbP56400 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms