Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab4aP56371 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms