Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp1P56183 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrp1P56183 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp1P56183 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms