Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msh2P43247 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msh2P43247 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msh2P43247 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msh2P43247 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msh2P43247 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Msh2P43247 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms