Protein–RNA interactions for Protein: P41317

Mbl2, Mannose-binding protein C, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl2P41317 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbl2P41317 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl2P41317 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl2P41317 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms