Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTF4P34130 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTF4P34130 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NTF4P34130 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTF4P34130 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTF4P34130 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTF4P34130 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTF4P34130 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTF4P34130 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTF4P34130 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTF4P34130 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTF4P34130 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTF4P34130 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTF4P34130 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTF4P34130 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms