Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxc11P31313 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc11P31313 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxc11P31313 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms