Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk4P30285 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk4P30285 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk4P30285 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms