Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mdm2P23804 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mdm2P23804 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mdm2P23804 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms