Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLS3P13797 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLS3P13797 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLS3P13797 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLS3P13797 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLS3P13797 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLS3P13797 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLS3P13797 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLS3P13797 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLS3P13797 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLS3P13797 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLS3P13797 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLS3P13797 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLS3P13797 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLS3P13797 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLS3P13797 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLS3P13797 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLS3P13797 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLS3P13797 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLS3P13797 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLS3P13797 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLS3P13797 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLS3P13797 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLS3P13797 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PLS3P13797 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLS3P13797 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLS3P13797 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLS3P13797 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLS3P13797 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PLS3P13797 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLS3P13797 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLS3P13797 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLS3P13797 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLS3P13797 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLS3P13797 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLS3P13797 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLS3P13797 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLS3P13797 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLS3P13797 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLS3P13797 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLS3P13797 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLS3P13797 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLS3P13797 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLS3P13797 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLS3P13797 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLS3P13797 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLS3P13797 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLS3P13797 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLS3P13797 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLS3P13797 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLS3P13797 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLS3P13797 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLS3P13797 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLS3P13797 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLS3P13797 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLS3P13797 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLS3P13797 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLS3P13797 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLS3P13797 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLS3P13797 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLS3P13797 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLS3P13797 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLS3P13797 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLS3P13797 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLS3P13797 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLS3P13797 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLS3P13797 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLS3P13797 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLS3P13797 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLS3P13797 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLS3P13797 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLS3P13797 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLS3P13797 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLS3P13797 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PLS3P13797 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms