Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spp1P10923 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spp1P10923 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spp1P10923 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spp1P10923 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spp1P10923 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spp1P10923 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spp1P10923 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms