Protein–RNA interactions for Protein: P0CW03

Ly6c2, Lymphocyte antigen 6C2, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c2P0CW03 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6c2P0CW03 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ly6c2P0CW03 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms