Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmg4P0C7N9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmg4P0C7N9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms