Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRCP08575 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRCP08575 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRCP08575 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms