Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P06323 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06323 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06323 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06323 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06323 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06323 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06323 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06323 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P06323 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06323 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06323 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06323 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06323 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P06323 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06323 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06323 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06323 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06323 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06323 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06323 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06323 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06323 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P06323 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P06323 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06323 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06323 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06323 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06323 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06323 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06323 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06323 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06323 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06323 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06323 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06323 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06323 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06323 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06323 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06323 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06323 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06323 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06323 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P06323 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06323 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06323 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06323 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06323 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06323 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06323 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06323 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06323 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06323 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06323 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06323 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06323 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06323 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06323 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06323 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06323 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P06323 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06323 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06323 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06323 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms