Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01661 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P01661 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01661 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01661 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01661 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01661 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01661 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P01661 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01661 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01661 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01661 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01661 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01661 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01661 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01661 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01661 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01661 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01661 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01661 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01661 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01661 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01661 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01661 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01661 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01661 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01661 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01661 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01661 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01661 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01661 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01661 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01661 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01661 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01661 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01661 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01661 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01661 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01661 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01661 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01661 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01661 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01661 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms