Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ccl20O89093 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ccl20O89093 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Ccl20O89093 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Ccl20O89093 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Ccl20O89093 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Ccl20O89093 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Ccl20O89093 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Ccl20O89093 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Ccl20O89093 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Ccl20O89093 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ccl20O89093 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ccl20O89093 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl20O89093 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms