Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CpdO89001 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CpdO89001 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CpdO89001 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CpdO89001 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CpdO89001 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CpdO89001 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CpdO89001 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CpdO89001 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CpdO89001 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CpdO89001 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CpdO89001 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CpdO89001 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CpdO89001 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CpdO89001 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CpdO89001 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CpdO89001 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CpdO89001 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CpdO89001 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CpdO89001 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CpdO89001 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CpdO89001 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CpdO89001 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CpdO89001 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CpdO89001 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CpdO89001 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CpdO89001 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CpdO89001 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CpdO89001 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CpdO89001 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CpdO89001 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CpdO89001 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CpdO89001 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CpdO89001 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CpdO89001 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CpdO89001 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CpdO89001 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CpdO89001 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CpdO89001 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CpdO89001 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CpdO89001 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CpdO89001 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CpdO89001 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CpdO89001 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CpdO89001 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CpdO89001 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CpdO89001 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CpdO89001 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CpdO89001 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CpdO89001 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CpdO89001 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CpdO89001 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CpdO89001 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CpdO89001 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CpdO89001 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CpdO89001 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CpdO89001 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CpdO89001 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CpdO89001 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CpdO89001 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CpdO89001 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CpdO89001 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CpdO89001 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CpdO89001 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CpdO89001 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CpdO89001 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CpdO89001 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CpdO89001 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CpdO89001 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 711.6 ms