Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfdp1O88271 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cfdp1O88271 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfdp1O88271 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms