Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3dO70194 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3dO70194 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3dO70194 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms