Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ldb2O55203 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldb2O55203 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldb2O55203 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms