Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom1O54990 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom1O54990 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom1O54990 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom1O54990 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom1O54990 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom1O54990 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom1O54990 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom1O54990 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms