Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sema6aO35464 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sema6aO35464 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6aO35464 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6aO35464 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6aO35464 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6aO35464 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6aO35464 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sema6aO35464 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms