Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe40O35185 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bhlhe40O35185 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms