Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArxO35085 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArxO35085 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArxO35085 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArxO35085 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ArxO35085 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ArxO35085 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ArxO35085 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ArxO35085 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ArxO35085 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ArxO35085 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArxO35085 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArxO35085 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArxO35085 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArxO35085 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArxO35085 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArxO35085 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArxO35085 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ArxO35085 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ArxO35085 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ArxO35085 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ArxO35085 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ArxO35085 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ArxO35085 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ArxO35085 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ArxO35085 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArxO35085 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArxO35085 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArxO35085 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArxO35085 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ArxO35085 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ArxO35085 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ArxO35085 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ArxO35085 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ArxO35085 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArxO35085 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArxO35085 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArxO35085 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArxO35085 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArxO35085 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArxO35085 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArxO35085 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArxO35085 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ArxO35085 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArxO35085 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArxO35085 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArxO35085 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArxO35085 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ArxO35085 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ArxO35085 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArxO35085 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ArxO35085 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArxO35085 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArxO35085 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArxO35085 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArxO35085 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArxO35085 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArxO35085 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ArxO35085 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ArxO35085 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ArxO35085 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArxO35085 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArxO35085 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArxO35085 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArxO35085 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArxO35085 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ArxO35085 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArxO35085 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ArxO35085 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ArxO35085 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ArxO35085 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ArxO35085 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ArxO35085 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ArxO35085 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArxO35085 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArxO35085 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArxO35085 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ArxO35085 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ArxO35085 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ArxO35085 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ArxO35085 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ArxO35085 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArxO35085 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArxO35085 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArxO35085 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ArxO35085 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArxO35085 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ArxO35085 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ArxO35085 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ArxO35085 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms