Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dctn1O08788 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dctn1O08788 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms