Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8909G3UXE9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8909G3UXE9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms