Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1bF6V0H0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pagr1bF6V0H0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pagr1bF6V0H0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1bF6V0H0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms