Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3072F6SKY8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3072F6SKY8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms