Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf165E9QAU8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms