Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3250E9Q1M3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3250E9Q1M3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3250E9Q1M3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms