Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
3425401B19RikD3Z1D3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
3425401B19RikD3Z1D3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
3425401B19RikD3Z1D3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms