Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfia4B8QI36 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfia4B8QI36 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia4B8QI36 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms