Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed5B2RPU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed5B2RPU8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed5B2RPU8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed5B2RPU8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zbed5B2RPU8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed5B2RPU8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed5B2RPU8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms