Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fibcd1A2AV25 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fibcd1A2AV25 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms