Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms