Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms