Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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