Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arv1Q9D0U9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arv1Q9D0U9 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.2 ms